武将和副将的选配是万国觉醒战斗体系的核心要素之一。主将和副将的组合直接影响部队的战斗力，因此在搭配时需要综合考虑兵种加成、技能联动以及战术需求。主将需达到三星以上星级才能解锁副将槽位，而副将最高只需练至四星以启用第四技能，这种设计降低了培养副将的资源压力。兵种专精加成的匹配至关重要，例如纯骑兵队应优先选择曹操、源义经等骑兵统帅，而步兵队则以理查、查理等为优选，确保主副将的兵种加成一致才能最大化输出或防御效果。
主将通常承担核心输出或防御职能，而副将则提供辅助效果，例如治疗、减伤或控场。孙武作为紫将中泛用性极高的步兵统帅，其范围伤害技能适合搭配理查的减伤或李成桂的爆发性输出；骑兵组合如成吉思汗与曹操则依赖高速普攻和技能循环压制对手。需副将的技能触发顺序可能影响战局，因此需优先选择与主将技能节奏契合的副将。
不同战斗场景对主副将的需求差异显著。野战环境中，生存能力和范围伤害是重点，亚历山大与理查的组合凭借高额减伤和回血成为步兵野战的热门选择；集结进攻时，单一兵种的极致输出更为重要，例如阿提拉与武田信玄的纯骑组合能快速突破防御。驻防场景则需兼顾反击与抗压能力，查理与君士坦丁的搭配能有效抵御多轮进攻。副将的装备加成无效，资源应集中用于主将的装备强化。
平民玩家需优先培养性价比高的紫将，如孙武、贝利撒留、贞德等，这些武将觉醒难度低且实战表现优异。远征商店兑换的埃塞尔弗莱德是零氪玩家获取橙将的主要途径，可搭配主将形成过渡组合。氪金玩家则可围绕核心橙将如关羽、爱德华等构建体系，但需注意橙将觉醒周期较长，前期应避免分散投资。采集类武将仅需提升至37级并点满采集天赋，无需占用主副将培养资源。
前期混合兵种队伍更为实用，如源义经与曹操的骑兵混编能应对多数PVE场景；中后期则需转向纯兵种专精，例如纯弓队的爱德华与李成桂能发挥极致AOE伤害。失落之地等大型活动中，武将组合需根据敌方阵容实时调整，例如面对骑兵集结时，步兵驻防队可选用查理与李成桂的反制组合。定期参考实战评级和玩家社区反馈有助于优化选配策略。
